Vědci s pomocí superpočítače zkoumají, jak usnadnit operace tlustého střeva
Ostravští vědci ve spolupráci s lékaři vyvíjejí nástroj, který může výrazně zkrátit operace tlustého střeva a zároveň sníží riziko komplikací. Pomocí umělé inteligence a superpočítače vytvářejí 3D modely cév. Díky nim lékaři před zákrokem uvidí kudy přesně vedou tepny a žíly v břišní dutině. Každý rok lékaři v ostravské fakultní nemocnici provedou zhruba 340 operací u pacientů s rakovinou tlustého střeva. A právě znalost přesné polohy cév je při zákrocích zásadní.
„Cévní systém v břiše je velmi variabilní a u každého člověka jiný. Když lékař zná jeho průběh, může lépe naplánovat operaci a snížit riziko, že dojde ke komplikacím. Navíc u kolorektálního karcinomu díky tomu můžeme provést operaci dostatečně onkologicky radikálně, aby byl zákrok pro pacienta co nejúčinnější,“ vysvětluje Lubomír Martínek, přednosta Chirurgické kliniky Fakultní nemocnice Ostrava.
Vědci a lékaři proto společně pracují na tom, aby chirurgové měli k dispozici podrobný 3D model cév ještě před samotným zákrokem. „Vytipovali jsme 60 pacientů, u nichž jsme na CT snímcích vyznačili cévy. Bylo to velmi obtížné, protože v břišní dutině se nachází desítky tepen a žil. Manuální segmentace, kdy se identifikují a označí všechny cévy větší než 2 mm, nám u jednoho pacienta zabrala 5 až 6 hodin,“ popisuje chirurg Jan Hrubovčák.
Výsledkem práce ostravských lékařů je unikátní dataset, který využívají výzkumníci z Fakulty elektrotechniky a informatiky (FEI) a Národního superpočítačového centra IT4Innovations. „Naším úkolem bylo vyvinout 3D segmentační algoritmus založený na hlubokém učení. Ten se učí rozpoznávat cévní struktury podle vzorů, jak je určil lékař,“ vysvětluje Jan Kubíček z FEI.
Trénování algoritmu probíhá na superpočítači
„Vytváříme neuronovou síť, která z obrazových dat pacienta dokáže automaticky určit cévní řečiště v břišní oblasti. Zatímco lékař segmentuje cévy několik hodin, aktuální model to zvládne u tepen za 2,5 minuty a stejný čas potřebuje na žíly,“ doplil Petr Strakoš z IT4Innovations.
První výsledky vypadají podle lékařů velmi slibně. Hotový je již 3D model tepen, nyní se tým zaměří na modelování žil a vývoj specializovaného modelu pro kritické cévy, které se vyskytují v blízkosti nádorů. Cílem je vytvořit webovou aplikaci, do které lékař nahraje data konkrétního pacienta a během několika minut získá přesný 3D model cévního systému.
„Přesnější plánování operace, zkrácení doby zákroku a snížení rizika před i pooperačních komplikací přímo ovlivňují prognózu a šance na vyléčení pacienta. Pokud by algoritmus dokázal segmentovat cévy v reálném čase, mohl by najít široké uplatnění nejen ve výzkumu, ale i v běžné klinické praxi,“ dodává přednosta Martínek.
